Археологическая лаборатория проводит комплексные научные исследования древнейшей истории Юго-Восточной Прибалтики на современном научном уровне с учётом новейших достижений гуманитарных и естественных наук, осуществляет археологическую деятельность на территории Калининградской области (полевые исследования объектов культурного наследия, проведение научных археологических раскопок и разведок, камеральная обработка полученных материалов, подготовка и написание научных отчетов).